基因芯片（基因芯片检测是什么意思）

基因芯片与SNP技术区别

一、原理不同

1、SNP技术：首先，用聚合酶链反应（PCR）扩增含单核苷酸多态性的基因组片段，然后用序列特异性引物进行单碱基扩增。然后将样品分析物与芯片基体共结晶，在真空管中用瞬时纳秒（10-9s）激光进行激发。

2、基因芯片：测序原理是杂交测序法，即用已知序列的一组核酸探针杂交的核酸测序法。

二、特点不同

1、SNP技术：时间飞行质谱（MALDI-TOF）完成的SNP检测准确率可达99.9%，除了准确性高、灵活性强、通量大、检测周期短等优势外，最有吸引力的应该还是它的性价比。

2、基因芯片：快速、高效、自动化。

扩展资料：

基因芯片可分为三种主要类型：

（1）固定在聚合物基质（尼龙膜、硝酸纤维膜等）表面的核酸探针或DNA片段，通常与同位素标记的靶基因杂交检测。通过射线照相。

这种方法的优点是所需的检测设备与目前分子生物学中使用的射线照相技术相一致，并且相对成熟。但芯片上探针密度不高，对样品和试剂的需求量大，定量检测存在诸多问题。

（2）采用点采样法将DNA探针阵列固定在玻璃板上，与荧光标记靶基因杂交检测。该方法的晶格密度可大幅度提高，表面各探针的结合量相对一致，但在标准化和批量生产方面仍存在不易克服的困难。

（3）将直接在玻璃等硬表面上合成的寡核苷酸探针阵列与荧光标记靶基因杂交检测。该方法将微电子光刻技术与DNA化学合成技术相结合，可大大提高基因芯片的探针密度，减少试剂用量，实现标准化和批量生产，具有非常重要的发展潜力。

参考资料来源：百度百科-基因芯片

参考资料来源：百度百科-SNP基因分型

什么是基因芯片

基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期发展出来的高科技产物.基因芯片大小如指甲盖一般,其基质一般是经过处理后的玻璃片.每个芯片的基面上都可划分出数万至数百万个小区.在指定的小区内,可固定大量具有特定功能、长约...

基因芯片是建立在哪种技术的基础之上

基因芯片是建立在Southernblot技术的基础之上。根据查询相关公开信息显示，基因芯片技术是建立在Southernblot基础之上的，是Southernblot的改进和发展，原理是：变性DNA加入探针后在一定温度下退火，同源片段之间通过碱基互补形成双链杂交分子。

基因芯片与基因测序的差异？

1.检测原理

基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法。由于探针序列是根据目标序列进行设计，是确定的，因此，芯片是个相对封闭的系统。换句话说，芯片只能对已知的序列进行检测。

第一代和第二代测序技术除了通量和成本上的差异之外，其测序核心原理（除Solid是边连接边测序之外）都是基于边合成边测序的思想。第二代测序技术的优点是成本较之一代大大下降，通量大大提升，但缺点是所引入PCR过程会在一定程度上增加测序的错误率，并且具有系统偏向性，同时读长也比较短。

第三代测序技术是为了解决第二代所存在的缺点而开发的，与前两代相比，它的根本特点是单分子测序，不需要任何PCR的过程，这是为了能有效避免因PCR偏向性而导致的系统错误，同时提高读长，并要保持二代技术的高通量，低成本的优点。

在测序未普及前，芯片是最常使用的大规模筛查工具，如人基因表达谱芯片，一次实验就可以对人类已知的2~3万个基因进行筛查，找出关键差异基因。我们知道，芯片是基于探针与目标序列杂交结合的原理进行检测。由于探针序列是根据目标序列进行设计，是确定的，因此，芯片是个相对封闭的系统。换句话说，芯片只能对已知的序列进行检测。

2.检测场景

基因测序有相同也有不同的检测场景。比如研究参考序列较丰富物种的表达谱，虽然用芯片和测序都可以，但是用芯片进行定量会更为准确。又比如参考序列较少的物种，要做定量分析，选择测序就更为合适，既能测定序列又能做定量分析。如果想发现新的转录本，或者研究基因表达的可变剪接等，选择测序准没错。也有一些研究，会将两者结合，先用测序获得序列信息，再用芯片进行定量分析，发挥两种手段各自的优势。

基因芯片技术对于已知基因突变的筛查具有明显优势，可以快速、全面地检测出目标基因突变。测序能有效检测致病基因、易感基因位点以及含量极低的突变基因，不仅对于单基因遗传病是一个很好的研究手段，对于许多常见病，如肿瘤、糖尿病等疾病也可进行大规模比较研究。测序对已发生疾病（临床）检出率方面略优于基因芯片。

3.实验周期

相比于测序，无论是实验过程还是数据分析过程，芯片都更为成熟和简单。因而芯片的实验周期通常约为测序的一半时间或者更短。

4.价格

与基因测序相比，基因芯片性价比高，一张基因芯片可以实现mRNA，lncRNA，circRNA不同种类的RNA全基因组检测。

总结重点:

基因芯片只能检测已知基因

高通量测序可以检测到未知基因

参考学习链接：

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